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湖南20例新冠病毒標(biāo)本測序,與南京高度同源

發(fā)布時(shí)間:2021-08-02   點(diǎn)擊率:965
澎湃新聞
新湖南客戶端、@湖南日報(bào)

記者今日獲悉,自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本以來,湖南省疾控中心已完成20例德爾塔新冠病毒基因組測序。已經(jīng)完成測序結(jié)果的標(biāo)本均為德爾塔毒株,與南京高度同源。

5天時(shí)間已完成20例標(biāo)本測序

據(jù)省疾控中心檢驗(yàn)科科長湛志飛介紹,基因組測序可在第一時(shí)間獲取新發(fā)未知病毒的基因組序列信息,已成為研究疾病暴發(fā)的重要工具。通過構(gòu)建進(jìn)化樹,研究不同患者病毒遺傳序列變化,能在分子生物學(xué)層面揭示病毒的傳播方式,分析新冠病毒的進(jìn)化來源,研究新冠病毒的致病病理機(jī)制,為控制疫情暴發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。

通過檢測新冠病毒的全基因組序列,再將這個(gè)序列通過算法與數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì),可以初步判斷其地域來源。將序列與既往病例序列進(jìn)行比對(duì),如果序列在同一進(jìn)化樹分支上,則可以判斷這些病例是否來自同一傳播鏈或傳染源。

面對(duì)此次疫情,從7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本以來,湖南省疾控已完成20例標(biāo)本測序。

24小時(shí)完成病毒基因測序溯源

“新冠病毒樣本送到實(shí)驗(yàn)室后,一般需要經(jīng)過多個(gè)步驟完成檢測?!闭恐撅w稱,在接到陽性樣本后,工作人員首先進(jìn)行復(fù)核工作,對(duì)樣本進(jìn)行核酸提取,再用兩種試劑進(jìn)行核酸檢測。復(fù)核陽性的標(biāo)本,分別用二代和三代高通量測序技術(shù)進(jìn)行序列測定,為病毒溯源工作設(shè)置“雙保險(xiǎn)”,確保萬無一失。

病毒基因序列測定完成后,工作人員還要馬上進(jìn)行生物信息學(xué)分析,將病毒序列與數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行比對(duì),查看有無變異位點(diǎn),進(jìn)行同源性比較。完成數(shù)據(jù)比對(duì)后,還要及時(shí)撰寫溯源報(bào)告。

“目前,湖南省疾控中心已具備新冠病毒基因組高通量二代和三代測序能力,為湖南省新型冠狀病毒疫情以及其他傳染病病原體的鑒定和溯源、防控應(yīng)對(duì)提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐?!闭恐撅w介紹,去年10月份才掌握這項(xiàng)技術(shù),以前都是送到國家疾控中心檢測。目前湖南省疾控中心培養(yǎng)了3名技術(shù)骨干,所有的新冠病毒基因組測序都能在24小時(shí)內(nèi)完成,情況復(fù)雜的也不會(huì)超過48小時(shí)。根據(jù)疫情的變化,只要有標(biāo)本來,都會(huì)在24小時(shí)內(nèi)啟動(dòng)測序流程。

測序結(jié)果與南京高度同源

7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本測序工作以來,省疾控中心立即組織專業(yè)技術(shù)人員,日夜不停地開展測序工作,通過文庫制備、簇生成、上機(jī)測序與數(shù)據(jù)比對(duì)分析,已經(jīng)完成測序結(jié)果的標(biāo)本均為德爾塔毒株。從國家疾控中心反饋的結(jié)果顯示,和江蘇省報(bào)送的南京疫情本土病例新冠病毒基因組序列高度同源。

根據(jù)最新疫情通報(bào),2021年7月20日0時(shí)至8月1日24時(shí),湖南省累計(jì)報(bào)告新型冠狀病毒肺炎確診病例22例。此次疫情病原體為德爾塔變異株,范圍廣、來勢猛,廣大民眾一定不能掉以輕心,嚴(yán)格執(zhí)行好持碼進(jìn)出、測量體溫、佩戴口罩、保持距離等措施,有效降低病毒傳播風(fēng)險(xiǎn),減少不必要的人員聚集。

湖南:暫停各級(jí)各類學(xué)校校內(nèi)校外
線下教育教學(xué)活動(dòng)

鑒于當(dāng)前湖南省嚴(yán)峻的疫情防控形勢,8月2日,湖南省教育廳下發(fā)緊急通知,要求暫停校內(nèi)校外線下教育教學(xué)活動(dòng)。

通知要求,暫停各級(jí)各類學(xué)校校內(nèi)校外線下教育教學(xué)活動(dòng);暫停各級(jí)各類教育培訓(xùn)機(jī)構(gòu)線下培訓(xùn)活動(dòng)。

同時(shí),各級(jí)各類學(xué)校師生員工要嚴(yán)格遵守屬地疫情防控相關(guān)規(guī)定,近期非必要不出行。

各級(jí)教育行政部門、各高校要堅(jiān)持一把手負(fù)總責(zé),加強(qiáng)疫情防控常態(tài)化措施落實(shí)情況督查,加強(qiáng)疫情防控緊急措施落實(shí)情況督查。違反上述規(guī)定的,一經(jīng)發(fā)現(xiàn),嚴(yán)肅查處。
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